Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp2Q9CUU3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms