Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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