Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubl4bQ9CQ84 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms