Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Use1Q9CQ56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Use1Q9CQ56 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Use1Q9CQ56 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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