Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StambpQ9CQ26 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms