Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg3Q9CPX6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms