Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Prpf8Q99PV0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prpf8Q99PV0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms