Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbx4Q99NE9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pbx4Q99NE9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbx4Q99NE9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms