Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms