Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf2Q99LE6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms