Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms