Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TriobpQ99KW3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms