Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms