Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg5Q99J83 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg5Q99J83 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms