Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms