Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ctu1Q99J10 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ctu1Q99J10 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms