Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbox1Q924Y0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms