Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf7Q922B6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms