Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ApofQ91V80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApofQ91V80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApofQ91V80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApofQ91V80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms