Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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