Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms