Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CipcQ8R0W1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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