Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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Nek9Q8K1R7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Nek9Q8K1R7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek9Q8K1R7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms