Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms