Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Afg3l2Q8JZQ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms