Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trpm6Q8CIR4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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