Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Csnka2ipQ8CH19 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Csnka2ipQ8CH19 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Csnka2ipQ8CH19 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csnka2ipQ8CH19 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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