Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
9030612E09RikQ8CE20 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms