Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc17Q8CE13 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms