Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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