Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm16223Q8CBM3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms