Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms