Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms