Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C5C9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms