Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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NcaphQ8C156 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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NcaphQ8C156 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NcaphQ8C156 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcaphQ8C156 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms