Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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