Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gga3Q8BMI3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms