Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms