Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4bQ8BGE6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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