Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cracr2bQ80ZJ8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms