Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Alkbh8Q80Y20 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh8Q80Y20 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Alkbh8Q80Y20 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Alkbh8Q80Y20 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Alkbh8Q80Y20 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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