Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AknaQ80VW7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AknaQ80VW7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms