Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccp110Q7TSH4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms