Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms