Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf139Q7TMV1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms