Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snd1Q78PY7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms