Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme8Q715T0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms