Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms