Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms