Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ino80Q6ZPV2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80Q6ZPV2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms